Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBP60709 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBP60709 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBP60709 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBP60709 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBP60709 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBP60709 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBP60709 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBP60709 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBP60709 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBP60709 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBP60709 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBP60709 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBP60709 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBP60709 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBP60709 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBP60709 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBP60709 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBP60709 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBP60709 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBP60709 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBP60709 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBP60709 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBP60709 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBP60709 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBP60709 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBP60709 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBP60709 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBP60709 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBP60709 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBP60709 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBP60709 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBP60709 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBP60709 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBP60709 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBP60709 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBP60709 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBP60709 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBP60709 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBP60709 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBP60709 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBP60709 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBP60709 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBP60709 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBP60709 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBP60709 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBP60709 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBP60709 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBP60709 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBP60709 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBP60709 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTBP60709 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTBP60709 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTBP60709 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTBP60709 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTBP60709 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTBP60709 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTBP60709 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTBP60709 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTBP60709 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTBP60709 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTBP60709 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTBP60709 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTBP60709 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTBP60709 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTBP60709 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTBP60709 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTBP60709 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTBP60709 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTBP60709 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTBP60709 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTBP60709 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTBP60709 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTBP60709 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTBP60709 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTBP60709 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTBP60709 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTBP60709 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTBP60709 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTBP60709 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTBP60709 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTBP60709 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTBP60709 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTBP60709 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTBP60709 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTBP60709 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTBP60709 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTBP60709 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTBP60709 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTBP60709 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTBP60709 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTBP60709 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTBP60709 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTBP60709 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTBP60709 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTBP60709 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTBP60709 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTBP60709 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTBP60709 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTBP60709 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms