Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PROK1P58294 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PROK1P58294 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PROK1P58294 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PROK1P58294 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PROK1P58294 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PROK1P58294 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PROK1P58294 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PROK1P58294 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PROK1P58294 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PROK1P58294 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PROK1P58294 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PROK1P58294 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PROK1P58294 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PROK1P58294 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PROK1P58294 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PROK1P58294 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PROK1P58294 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PROK1P58294 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PROK1P58294 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PROK1P58294 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PROK1P58294 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PROK1P58294 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PROK1P58294 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PROK1P58294 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PROK1P58294 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PROK1P58294 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PROK1P58294 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PROK1P58294 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PROK1P58294 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PROK1P58294 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PROK1P58294 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PROK1P58294 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PROK1P58294 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PROK1P58294 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PROK1P58294 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PROK1P58294 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PROK1P58294 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PROK1P58294 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PROK1P58294 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PROK1P58294 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PROK1P58294 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PROK1P58294 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PROK1P58294 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PROK1P58294 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PROK1P58294 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PROK1P58294 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PROK1P58294 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PROK1P58294 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PROK1P58294 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PROK1P58294 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PROK1P58294 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PROK1P58294 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PROK1P58294 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PROK1P58294 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PROK1P58294 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PROK1P58294 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PROK1P58294 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PROK1P58294 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PROK1P58294 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PROK1P58294 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PROK1P58294 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PROK1P58294 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PROK1P58294 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PROK1P58294 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PROK1P58294 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PROK1P58294 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PROK1P58294 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PROK1P58294 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PROK1P58294 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PROK1P58294 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PROK1P58294 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PROK1P58294 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PROK1P58294 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PROK1P58294 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PROK1P58294 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PROK1P58294 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PROK1P58294 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PROK1P58294 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PROK1P58294 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PROK1P58294 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PROK1P58294 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PROK1P58294 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PROK1P58294 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PROK1P58294 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PROK1P58294 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PROK1P58294 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PROK1P58294 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PROK1P58294 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PROK1P58294 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PROK1P58294 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PROK1P58294 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PROK1P58294 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PROK1P58294 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PROK1P58294 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PROK1P58294 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PROK1P58294 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PROK1P58294 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PROK1P58294 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PROK1P58294 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms