Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX16P57768 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX16P57768 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX16P57768 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX16P57768 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX16P57768 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX16P57768 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX16P57768 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX16P57768 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX16P57768 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX16P57768 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX16P57768 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX16P57768 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX16P57768 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX16P57768 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX16P57768 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX16P57768 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX16P57768 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX16P57768 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX16P57768 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX16P57768 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX16P57768 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX16P57768 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX16P57768 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX16P57768 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX16P57768 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX16P57768 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX16P57768 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX16P57768 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX16P57768 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX16P57768 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX16P57768 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX16P57768 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX16P57768 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX16P57768 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX16P57768 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX16P57768 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX16P57768 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX16P57768 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX16P57768 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX16P57768 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX16P57768 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX16P57768 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX16P57768 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX16P57768 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX16P57768 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX16P57768 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX16P57768 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX16P57768 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX16P57768 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX16P57768 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX16P57768 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX16P57768 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX16P57768 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX16P57768 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX16P57768 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX16P57768 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX16P57768 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX16P57768 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX16P57768 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX16P57768 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX16P57768 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX16P57768 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX16P57768 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX16P57768 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX16P57768 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX16P57768 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX16P57768 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX16P57768 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX16P57768 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX16P57768 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX16P57768 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX16P57768 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX16P57768 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX16P57768 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX16P57768 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX16P57768 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX16P57768 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX16P57768 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX16P57768 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX16P57768 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX16P57768 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX16P57768 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX16P57768 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX16P57768 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNX16P57768 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX16P57768 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX16P57768 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX16P57768 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX16P57768 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX16P57768 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX16P57768 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX16P57768 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX16P57768 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX16P57768 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX16P57768 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX16P57768 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX16P57768 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX16P57768 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX16P57768 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms