Protein–RNA interactions for Protein: P57087

JAM2, Junctional adhesion molecule B, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM2P57087 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
JAM2P57087 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
JAM2P57087 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
JAM2P57087 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
JAM2P57087 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
JAM2P57087 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
JAM2P57087 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
JAM2P57087 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
JAM2P57087 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
JAM2P57087 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
JAM2P57087 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
JAM2P57087 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
JAM2P57087 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
JAM2P57087 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
JAM2P57087 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
JAM2P57087 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
JAM2P57087 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
JAM2P57087 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
JAM2P57087 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
JAM2P57087 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
JAM2P57087 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
JAM2P57087 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
JAM2P57087 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
JAM2P57087 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
JAM2P57087 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
JAM2P57087 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
JAM2P57087 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
JAM2P57087 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
JAM2P57087 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
JAM2P57087 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
JAM2P57087 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
JAM2P57087 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
JAM2P57087 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
JAM2P57087 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
JAM2P57087 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
JAM2P57087 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
JAM2P57087 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
JAM2P57087 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
JAM2P57087 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
JAM2P57087 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
JAM2P57087 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
JAM2P57087 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
JAM2P57087 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
JAM2P57087 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
JAM2P57087 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
JAM2P57087 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
JAM2P57087 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
JAM2P57087 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
JAM2P57087 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
JAM2P57087 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
JAM2P57087 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
JAM2P57087 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
JAM2P57087 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
JAM2P57087 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
JAM2P57087 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
JAM2P57087 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
JAM2P57087 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
JAM2P57087 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
JAM2P57087 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
JAM2P57087 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
JAM2P57087 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
JAM2P57087 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
JAM2P57087 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
JAM2P57087 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
JAM2P57087 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
JAM2P57087 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
JAM2P57087 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
JAM2P57087 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
JAM2P57087 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
JAM2P57087 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
JAM2P57087 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
JAM2P57087 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
JAM2P57087 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
JAM2P57087 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
JAM2P57087 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
JAM2P57087 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
JAM2P57087 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
JAM2P57087 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
JAM2P57087 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
JAM2P57087 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
JAM2P57087 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
JAM2P57087 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
JAM2P57087 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
JAM2P57087 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
JAM2P57087 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
JAM2P57087 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
JAM2P57087 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
JAM2P57087 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
JAM2P57087 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
JAM2P57087 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
JAM2P57087 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
JAM2P57087 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
JAM2P57087 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
JAM2P57087 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
JAM2P57087 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
JAM2P57087 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
JAM2P57087 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
JAM2P57087 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
JAM2P57087 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
JAM2P57087 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms