Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GFRA1P56159 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms