Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB3P54753 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms