Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRAP54198 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRAP54198 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRAP54198 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRAP54198 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRAP54198 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRAP54198 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRAP54198 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRAP54198 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRAP54198 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRAP54198 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRAP54198 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRAP54198 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRAP54198 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRAP54198 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRAP54198 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRAP54198 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRAP54198 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HIRAP54198 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRAP54198 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRAP54198 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRAP54198 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRAP54198 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRAP54198 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRAP54198 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRAP54198 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRAP54198 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRAP54198 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRAP54198 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRAP54198 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRAP54198 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRAP54198 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRAP54198 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRAP54198 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRAP54198 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRAP54198 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRAP54198 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRAP54198 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRAP54198 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRAP54198 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRAP54198 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRAP54198 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRAP54198 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRAP54198 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRAP54198 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRAP54198 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRAP54198 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRAP54198 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRAP54198 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRAP54198 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRAP54198 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRAP54198 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRAP54198 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRAP54198 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRAP54198 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRAP54198 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRAP54198 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRAP54198 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRAP54198 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRAP54198 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRAP54198 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRAP54198 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRAP54198 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRAP54198 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRAP54198 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRAP54198 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRAP54198 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRAP54198 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRAP54198 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRAP54198 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRAP54198 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRAP54198 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRAP54198 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRAP54198 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRAP54198 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRAP54198 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRAP54198 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRAP54198 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRAP54198 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRAP54198 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRAP54198 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRAP54198 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRAP54198 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRAP54198 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRAP54198 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRAP54198 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRAP54198 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRAP54198 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRAP54198 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRAP54198 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRAP54198 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRAP54198 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRAP54198 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRAP54198 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRAP54198 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRAP54198 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRAP54198 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRAP54198 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRAP54198 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRAP54198 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms