Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A3P53794 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms