Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACLYP53396 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACLYP53396 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACLYP53396 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACLYP53396 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACLYP53396 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACLYP53396 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACLYP53396 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACLYP53396 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACLYP53396 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACLYP53396 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACLYP53396 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACLYP53396 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACLYP53396 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACLYP53396 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACLYP53396 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACLYP53396 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACLYP53396 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACLYP53396 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACLYP53396 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACLYP53396 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACLYP53396 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACLYP53396 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACLYP53396 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACLYP53396 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACLYP53396 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACLYP53396 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ACLYP53396 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACLYP53396 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACLYP53396 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACLYP53396 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACLYP53396 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACLYP53396 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACLYP53396 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACLYP53396 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACLYP53396 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACLYP53396 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACLYP53396 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACLYP53396 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACLYP53396 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACLYP53396 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACLYP53396 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACLYP53396 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACLYP53396 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACLYP53396 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACLYP53396 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACLYP53396 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACLYP53396 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACLYP53396 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACLYP53396 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACLYP53396 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACLYP53396 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACLYP53396 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACLYP53396 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACLYP53396 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACLYP53396 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACLYP53396 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACLYP53396 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACLYP53396 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACLYP53396 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACLYP53396 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACLYP53396 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACLYP53396 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACLYP53396 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACLYP53396 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACLYP53396 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACLYP53396 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACLYP53396 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACLYP53396 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACLYP53396 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACLYP53396 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACLYP53396 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACLYP53396 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACLYP53396 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACLYP53396 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACLYP53396 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACLYP53396 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACLYP53396 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ACLYP53396 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACLYP53396 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACLYP53396 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACLYP53396 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACLYP53396 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACLYP53396 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACLYP53396 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACLYP53396 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACLYP53396 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACLYP53396 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACLYP53396 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACLYP53396 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACLYP53396 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACLYP53396 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ACLYP53396 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACLYP53396 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACLYP53396 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACLYP53396 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACLYP53396 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACLYP53396 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ACLYP53396 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACLYP53396 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms