Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.32■■□□□ 1
THOP1P52888 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
THOP1P52888 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
THOP1P52888 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THOP1P52888 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THOP1P52888 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THOP1P52888 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
THOP1P52888 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
THOP1P52888 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
THOP1P52888 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
THOP1P52888 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.32■■□□□ 1
THOP1P52888 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
THOP1P52888 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THOP1P52888 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THOP1P52888 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
THOP1P52888 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
THOP1P52888 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THOP1P52888 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THOP1P52888 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.31■■□□□ 1
THOP1P52888 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THOP1P52888 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THOP1P52888 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.31■■□□□ 1
THOP1P52888 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THOP1P52888 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THOP1P52888 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
THOP1P52888 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
THOP1P52888 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THOP1P52888 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
THOP1P52888 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
THOP1P52888 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
THOP1P52888 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
THOP1P52888 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THOP1P52888 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THOP1P52888 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
THOP1P52888 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
THOP1P52888 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THOP1P52888 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THOP1P52888 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THOP1P52888 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
THOP1P52888 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THOP1P52888 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THOP1P52888 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THOP1P52888 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.3■■□□□ 1
THOP1P52888 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
THOP1P52888 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THOP1P52888 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THOP1P52888 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THOP1P52888 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THOP1P52888 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THOP1P52888 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THOP1P52888 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
THOP1P52888 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THOP1P52888 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THOP1P52888 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THOP1P52888 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
THOP1P52888 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THOP1P52888 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THOP1P52888 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
THOP1P52888 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.29■■□□□ 1
THOP1P52888 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THOP1P52888 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
THOP1P52888 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.29■■□□□ 1
THOP1P52888 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
THOP1P52888 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THOP1P52888 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THOP1P52888 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THOP1P52888 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THOP1P52888 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THOP1P52888 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
THOP1P52888 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
THOP1P52888 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.28■■□□□ 1
THOP1P52888 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
THOP1P52888 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
THOP1P52888 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
THOP1P52888 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
THOP1P52888 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THOP1P52888 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
THOP1P52888 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THOP1P52888 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THOP1P52888 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THOP1P52888 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
THOP1P52888 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
THOP1P52888 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
THOP1P52888 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THOP1P52888 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THOP1P52888 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THOP1P52888 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
THOP1P52888 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
THOP1P52888 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
THOP1P52888 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
THOP1P52888 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
THOP1P52888 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THOP1P52888 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
THOP1P52888 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THOP1P52888 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
THOP1P52888 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
THOP1P52888 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
THOP1P52888 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THOP1P52888 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
THOP1P52888 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms