Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDST1P52848 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDST1P52848 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDST1P52848 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDST1P52848 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDST1P52848 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDST1P52848 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDST1P52848 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDST1P52848 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDST1P52848 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDST1P52848 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NDST1P52848 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDST1P52848 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDST1P52848 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDST1P52848 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDST1P52848 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDST1P52848 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDST1P52848 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDST1P52848 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDST1P52848 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDST1P52848 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDST1P52848 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDST1P52848 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDST1P52848 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDST1P52848 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDST1P52848 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDST1P52848 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDST1P52848 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDST1P52848 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDST1P52848 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDST1P52848 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDST1P52848 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDST1P52848 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDST1P52848 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDST1P52848 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NDST1P52848 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDST1P52848 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDST1P52848 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDST1P52848 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDST1P52848 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDST1P52848 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDST1P52848 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDST1P52848 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDST1P52848 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDST1P52848 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDST1P52848 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDST1P52848 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDST1P52848 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDST1P52848 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDST1P52848 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDST1P52848 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDST1P52848 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDST1P52848 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDST1P52848 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDST1P52848 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDST1P52848 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDST1P52848 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDST1P52848 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDST1P52848 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDST1P52848 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDST1P52848 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDST1P52848 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDST1P52848 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDST1P52848 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDST1P52848 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDST1P52848 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDST1P52848 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDST1P52848 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDST1P52848 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDST1P52848 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDST1P52848 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NDST1P52848 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NDST1P52848 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDST1P52848 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NDST1P52848 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDST1P52848 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDST1P52848 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDST1P52848 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDST1P52848 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDST1P52848 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDST1P52848 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDST1P52848 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDST1P52848 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDST1P52848 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDST1P52848 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDST1P52848 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDST1P52848 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDST1P52848 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDST1P52848 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDST1P52848 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDST1P52848 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDST1P52848 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDST1P52848 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDST1P52848 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDST1P52848 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDST1P52848 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDST1P52848 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDST1P52848 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDST1P52848 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDST1P52848 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms