Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDR1P51861 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDR1P51861 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDR1P51861 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDR1P51861 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDR1P51861 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDR1P51861 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDR1P51861 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDR1P51861 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDR1P51861 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDR1P51861 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDR1P51861 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDR1P51861 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDR1P51861 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDR1P51861 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDR1P51861 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDR1P51861 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDR1P51861 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDR1P51861 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDR1P51861 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDR1P51861 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDR1P51861 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDR1P51861 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDR1P51861 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDR1P51861 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDR1P51861 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDR1P51861 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDR1P51861 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDR1P51861 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDR1P51861 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDR1P51861 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDR1P51861 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDR1P51861 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDR1P51861 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDR1P51861 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDR1P51861 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDR1P51861 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDR1P51861 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDR1P51861 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDR1P51861 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDR1P51861 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDR1P51861 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDR1P51861 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDR1P51861 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDR1P51861 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDR1P51861 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDR1P51861 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDR1P51861 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDR1P51861 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDR1P51861 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDR1P51861 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDR1P51861 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDR1P51861 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDR1P51861 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDR1P51861 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDR1P51861 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDR1P51861 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR1P51861 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR1P51861 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR1P51861 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR1P51861 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR1P51861 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR1P51861 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR1P51861 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR1P51861 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR1P51861 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR1P51861 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR1P51861 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR1P51861 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR1P51861 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR1P51861 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR1P51861 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR1P51861 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR1P51861 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR1P51861 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR1P51861 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR1P51861 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR1P51861 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR1P51861 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR1P51861 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDR1P51861 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDR1P51861 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDR1P51861 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDR1P51861 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDR1P51861 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDR1P51861 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDR1P51861 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDR1P51861 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDR1P51861 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDR1P51861 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDR1P51861 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDR1P51861 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDR1P51861 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDR1P51861 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDR1P51861 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDR1P51861 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDR1P51861 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDR1P51861 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDR1P51861 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDR1P51861 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms