Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC2P49815 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC2P49815 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC2P49815 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC2P49815 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC2P49815 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC2P49815 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC2P49815 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC2P49815 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC2P49815 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC2P49815 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC2P49815 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC2P49815 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC2P49815 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC2P49815 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC2P49815 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC2P49815 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC2P49815 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC2P49815 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC2P49815 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC2P49815 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC2P49815 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC2P49815 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC2P49815 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC2P49815 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC2P49815 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC2P49815 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC2P49815 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC2P49815 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC2P49815 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC2P49815 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC2P49815 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC2P49815 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC2P49815 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC2P49815 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC2P49815 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC2P49815 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC2P49815 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC2P49815 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC2P49815 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC2P49815 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC2P49815 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC2P49815 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC2P49815 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSC2P49815 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSC2P49815 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSC2P49815 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC2P49815 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC2P49815 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC2P49815 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC2P49815 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC2P49815 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC2P49815 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC2P49815 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC2P49815 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC2P49815 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC2P49815 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC2P49815 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC2P49815 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC2P49815 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC2P49815 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC2P49815 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC2P49815 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC2P49815 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC2P49815 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC2P49815 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC2P49815 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC2P49815 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC2P49815 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC2P49815 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC2P49815 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC2P49815 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC2P49815 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC2P49815 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC2P49815 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC2P49815 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC2P49815 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC2P49815 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC2P49815 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC2P49815 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC2P49815 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC2P49815 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC2P49815 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC2P49815 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC2P49815 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC2P49815 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC2P49815 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC2P49815 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC2P49815 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC2P49815 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC2P49815 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC2P49815 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC2P49815 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC2P49815 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC2P49815 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC2P49815 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC2P49815 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC2P49815 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC2P49815 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC2P49815 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms