Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RGS4P49798 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RGS4P49798 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RGS4P49798 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RGS4P49798 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RGS4P49798 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RGS4P49798 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RGS4P49798 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RGS4P49798 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RGS4P49798 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RGS4P49798 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RGS4P49798 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RGS4P49798 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RGS4P49798 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RGS4P49798 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RGS4P49798 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RGS4P49798 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RGS4P49798 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RGS4P49798 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RGS4P49798 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RGS4P49798 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RGS4P49798 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RGS4P49798 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RGS4P49798 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGS4P49798 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGS4P49798 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGS4P49798 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGS4P49798 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGS4P49798 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGS4P49798 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGS4P49798 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGS4P49798 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGS4P49798 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGS4P49798 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGS4P49798 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGS4P49798 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGS4P49798 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGS4P49798 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGS4P49798 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGS4P49798 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGS4P49798 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGS4P49798 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGS4P49798 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RGS4P49798 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGS4P49798 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGS4P49798 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGS4P49798 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGS4P49798 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGS4P49798 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGS4P49798 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGS4P49798 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGS4P49798 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGS4P49798 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGS4P49798 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGS4P49798 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGS4P49798 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGS4P49798 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGS4P49798 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGS4P49798 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGS4P49798 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGS4P49798 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGS4P49798 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGS4P49798 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGS4P49798 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGS4P49798 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGS4P49798 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGS4P49798 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGS4P49798 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGS4P49798 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGS4P49798 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGS4P49798 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RGS4P49798 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RGS4P49798 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RGS4P49798 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RGS4P49798 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms