Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRIM1P49642 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms