Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK8P49336 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK8P49336 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK8P49336 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK8P49336 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK8P49336 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK8P49336 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK8P49336 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK8P49336 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK8P49336 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK8P49336 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK8P49336 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK8P49336 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK8P49336 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK8P49336 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK8P49336 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK8P49336 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK8P49336 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK8P49336 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK8P49336 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK8P49336 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK8P49336 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK8P49336 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK8P49336 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK8P49336 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK8P49336 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK8P49336 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK8P49336 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK8P49336 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK8P49336 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK8P49336 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK8P49336 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK8P49336 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK8P49336 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK8P49336 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK8P49336 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK8P49336 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK8P49336 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK8P49336 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK8P49336 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK8P49336 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK8P49336 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK8P49336 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK8P49336 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK8P49336 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK8P49336 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK8P49336 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK8P49336 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK8P49336 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK8P49336 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK8P49336 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK8P49336 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK8P49336 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK8P49336 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK8P49336 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK8P49336 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK8P49336 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK8P49336 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK8P49336 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK8P49336 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK8P49336 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK8P49336 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK8P49336 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK8P49336 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK8P49336 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK8P49336 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK8P49336 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK8P49336 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK8P49336 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK8P49336 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK8P49336 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK8P49336 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK8P49336 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK8P49336 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK8P49336 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK8P49336 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK8P49336 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK8P49336 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK8P49336 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK8P49336 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK8P49336 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK8P49336 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK8P49336 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK8P49336 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK8P49336 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK8P49336 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK8P49336 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK8P49336 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK8P49336 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK8P49336 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK8P49336 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK8P49336 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK8P49336 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK8P49336 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK8P49336 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK8P49336 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK8P49336 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK8P49336 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK8P49336 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK8P49336 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms