Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT6CP48668 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms