Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms