Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLMP48507 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLMP48507 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLMP48507 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLMP48507 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLMP48507 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLMP48507 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLMP48507 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLMP48507 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLMP48507 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLMP48507 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLMP48507 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLMP48507 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLMP48507 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLMP48507 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLMP48507 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLMP48507 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLMP48507 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLMP48507 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLMP48507 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLMP48507 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLMP48507 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLMP48507 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLMP48507 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCLMP48507 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCLMP48507 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCLMP48507 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCLMP48507 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCLMP48507 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GCLMP48507 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GCLMP48507 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCLMP48507 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCLMP48507 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCLMP48507 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCLMP48507 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCLMP48507 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCLMP48507 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCLMP48507 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLMP48507 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLMP48507 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLMP48507 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLMP48507 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLMP48507 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLMP48507 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLMP48507 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLMP48507 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLMP48507 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLMP48507 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLMP48507 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCLMP48507 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCLMP48507 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCLMP48507 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCLMP48507 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCLMP48507 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCLMP48507 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCLMP48507 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCLMP48507 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCLMP48507 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLMP48507 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLMP48507 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLMP48507 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLMP48507 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLMP48507 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLMP48507 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLMP48507 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLMP48507 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLMP48507 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLMP48507 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLMP48507 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLMP48507 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLMP48507 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLMP48507 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLMP48507 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLMP48507 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLMP48507 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLMP48507 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLMP48507 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLMP48507 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLMP48507 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLMP48507 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLMP48507 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLMP48507 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLMP48507 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLMP48507 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLMP48507 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLMP48507 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLMP48507 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLMP48507 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLMP48507 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLMP48507 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLMP48507 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLMP48507 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLMP48507 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLMP48507 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLMP48507 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLMP48507 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLMP48507 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLMP48507 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLMP48507 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLMP48507 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms