Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PIP4K2AP48426 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms