Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMC4P43686 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMC4P43686 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMC4P43686 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMC4P43686 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMC4P43686 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMC4P43686 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMC4P43686 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMC4P43686 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMC4P43686 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMC4P43686 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMC4P43686 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMC4P43686 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMC4P43686 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMC4P43686 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMC4P43686 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMC4P43686 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMC4P43686 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMC4P43686 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms