Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms