Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms