Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARL4AP40617 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL4AP40617 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms