Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms