Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT2P35908 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT2P35908 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT2P35908 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT2P35908 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT2P35908 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT2P35908 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT2P35908 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT2P35908 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT2P35908 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT2P35908 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT2P35908 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT2P35908 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT2P35908 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT2P35908 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT2P35908 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT2P35908 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT2P35908 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT2P35908 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT2P35908 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT2P35908 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT2P35908 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT2P35908 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT2P35908 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT2P35908 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT2P35908 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT2P35908 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT2P35908 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT2P35908 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT2P35908 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT2P35908 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT2P35908 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT2P35908 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT2P35908 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT2P35908 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT2P35908 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT2P35908 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT2P35908 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT2P35908 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT2P35908 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT2P35908 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT2P35908 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT2P35908 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT2P35908 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT2P35908 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT2P35908 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT2P35908 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT2P35908 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT2P35908 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT2P35908 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT2P35908 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT2P35908 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT2P35908 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT2P35908 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT2P35908 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT2P35908 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT2P35908 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT2P35908 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT2P35908 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT2P35908 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT2P35908 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT2P35908 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT2P35908 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT2P35908 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT2P35908 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT2P35908 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT2P35908 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT2P35908 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT2P35908 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT2P35908 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT2P35908 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT2P35908 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT2P35908 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT2P35908 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT2P35908 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT2P35908 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT2P35908 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT2P35908 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT2P35908 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT2P35908 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT2P35908 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT2P35908 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT2P35908 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT2P35908 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT2P35908 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT2P35908 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT2P35908 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT2P35908 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT2P35908 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT2P35908 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT2P35908 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT2P35908 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT2P35908 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT2P35908 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT2P35908 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT2P35908 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT2P35908 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT2P35908 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT2P35908 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT2P35908 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms