Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA1P35221 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms