Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA4P35212 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJA4P35212 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJA4P35212 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJA4P35212 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJA4P35212 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJA4P35212 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA4P35212 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA4P35212 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA4P35212 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA4P35212 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA4P35212 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA4P35212 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA4P35212 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA4P35212 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA4P35212 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA4P35212 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA4P35212 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA4P35212 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA4P35212 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA4P35212 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA4P35212 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA4P35212 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA4P35212 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA4P35212 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA4P35212 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA4P35212 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA4P35212 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA4P35212 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA4P35212 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA4P35212 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA4P35212 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA4P35212 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA4P35212 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA4P35212 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA4P35212 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA4P35212 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA4P35212 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA4P35212 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA4P35212 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA4P35212 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA4P35212 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA4P35212 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA4P35212 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA4P35212 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA4P35212 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA4P35212 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA4P35212 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA4P35212 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA4P35212 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA4P35212 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA4P35212 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA4P35212 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA4P35212 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA4P35212 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA4P35212 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA4P35212 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA4P35212 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA4P35212 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA4P35212 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA4P35212 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA4P35212 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA4P35212 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA4P35212 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA4P35212 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA4P35212 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA4P35212 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA4P35212 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA4P35212 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA4P35212 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA4P35212 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA4P35212 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA4P35212 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA4P35212 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA4P35212 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA4P35212 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA4P35212 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA4P35212 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA4P35212 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA4P35212 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA4P35212 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA4P35212 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA4P35212 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA4P35212 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA4P35212 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA4P35212 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA4P35212 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA4P35212 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA4P35212 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA4P35212 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA4P35212 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA4P35212 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA4P35212 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA4P35212 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA4P35212 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA4P35212 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA4P35212 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA4P35212 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJA4P35212 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJA4P35212 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms