Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCD1P33897 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD1P33897 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms