Protein–RNA interactions for Protein: P33400

RIM101, pH-response transcription factor pacC/RIM101, yeastyeast

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIM101P33400 SPE3YPR069C 882 nt7.37□□□□□ -1.23
RIM101P33400 PPZ1YML016C 2079 nt7.37□□□□□ -1.23
RIM101P33400 SLA2YNL243W 2907 nt7.37□□□□□ -1.23
RIM101P33400 MNN2YBR015C 1794 nt7.36□□□□□ -1.23
RIM101P33400 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt7.36□□□□□ -1.23
RIM101P33400 YER076W-AYER076W-A 348 nt7.36□□□□□ -1.23
RIM101P33400 PUP3YER094C 618 nt7.36□□□□□ -1.23
RIM101P33400 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt7.36□□□□□ -1.23
RIM101P33400 BUD28YLR062C 378 nt7.36□□□□□ -1.23
RIM101P33400 TAF9YMR236W 474 nt7.36□□□□□ -1.23
RIM101P33400 INO4YOL108C 456 nt7.36□□□□□ -1.23
RIM101P33400 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt7.36□□□□□ -1.23
RIM101P33400 IDH2YOR136W 1110 nt7.36□□□□□ -1.23
RIM101P33400 YAH1YPL252C 519 nt7.36□□□□□ -1.23
RIM101P33400 VAC8YEL013W 1737 nt7.35□□□□□ -1.23
RIM101P33400 TUF1YOR187W 1314 nt7.35□□□□□ -1.23
RIM101P33400 SWP82YFL049W 1872 nt7.35□□□□□ -1.23
RIM101P33400 DIE2YGR227W 1578 nt7.35□□□□□ -1.23
RIM101P33400 MSL1YIR009W 336 nt7.35□□□□□ -1.23
RIM101P33400 YLR458WYLR458W 381 nt7.35□□□□□ -1.23
RIM101P33400 OST6YML019W 999 nt7.35□□□□□ -1.23
RIM101P33400 RPS16AYMR143W 432 nt7.35□□□□□ -1.23
RIM101P33400 HSP26YBR072W 645 nt7.35□□□□□ -1.23
RIM101P33400 THS1YIL078W 2205 nt7.35□□□□□ -1.23
RIM101P33400 SCW11YGL028C 1629 nt7.34□□□□□ -1.23
RIM101P33400 GPT2YKR067W 2232 nt7.34□□□□□ -1.23
RIM101P33400 YDR344CYDR344C 444 nt7.34□□□□□ -1.23
RIM101P33400 YJL135WYJL135W 318 nt7.34□□□□□ -1.23
RIM101P33400 PAM18YLR008C 507 nt7.34□□□□□ -1.23
RIM101P33400 BUD14YAR014C 2130 nt7.34□□□□□ -1.23
RIM101P33400 EFT2YDR385W 2529 nt7.34□□□□□ -1.23
RIM101P33400 EFT1YOR133W 2529 nt7.34□□□□□ -1.23
RIM101P33400 YBP1YBR216C 2025 nt7.34□□□□□ -1.24
RIM101P33400 PHO90YJL198W 2646 nt7.33□□□□□ -1.24
RIM101P33400 LEU1YGL009C 2340 nt7.33□□□□□ -1.24
RIM101P33400 ACS2YLR153C 2052 nt7.33□□□□□ -1.24
RIM101P33400 IRC2YDR112W 309 nt7.33□□□□□ -1.24
RIM101P33400 YGL149WYGL149W 306 nt7.33□□□□□ -1.24
RIM101P33400 THI4YGR144W 981 nt7.33□□□□□ -1.24
RIM101P33400 MTR3YGR158C 753 nt7.33□□□□□ -1.24
RIM101P33400 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt7.33□□□□□ -1.24
RIM101P33400 RLF2YPR018W 1821 nt7.33□□□□□ -1.24
RIM101P33400 SHS1YDL225W 1656 nt7.32□□□□□ -1.24
RIM101P33400 WHI3YNL197C 1986 nt7.32□□□□□ -1.24
RIM101P33400 CPR5YDR304C 678 nt7.32□□□□□ -1.24
RIM101P33400 YOR302WYOR302W 78 nt7.32□□□□□ -1.24
RIM101P33400 RHO1YPR165W 630 nt7.32□□□□□ -1.24
RIM101P33400 FLC3YGL139W 2409 nt7.32□□□□□ -1.24
RIM101P33400 PAH1YMR165C 2589 nt7.32□□□□□ -1.24
RIM101P33400 BNA4YBL098W 1383 nt7.32□□□□□ -1.24
RIM101P33400 CST6YIL036W 1764 nt7.31□□□□□ -1.24
RIM101P33400 LSG1YGL099W 1923 nt7.31□□□□□ -1.24
RIM101P33400 YLL058WYLL058W 1728 nt7.31□□□□□ -1.24
RIM101P33400 PGA1YNL158W 597 nt7.31□□□□□ -1.24
RIM101P33400 GDT1YBR187W 843 nt7.31□□□□□ -1.24
RIM101P33400 CSC1YLR241W 2349 nt7.3□□□□□ -1.24
RIM101P33400 YDR476CYDR476C 675 nt7.3□□□□□ -1.24
RIM101P33400 CAX4YGR036C 720 nt7.3□□□□□ -1.24
RIM101P33400 MNS1YJR131W 1650 nt7.3□□□□□ -1.24
RIM101P33400 MKT1YNL085W 2493 nt7.3□□□□□ -1.24
RIM101P33400 ATP2YJR121W 1536 nt7.3□□□□□ -1.24
RIM101P33400 GPI10YGL142C 1851 nt7.3□□□□□ -1.24
RIM101P33400 UBA2YDR390C 1911 nt7.29□□□□□ -1.24
RIM101P33400 ARG81YML099C 2643 nt7.29□□□□□ -1.24
RIM101P33400 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt7.29□□□□□ -1.24
RIM101P33400 GPI8YDR331W 1236 nt7.29□□□□□ -1.24
RIM101P33400 YER067C-AYER067C-A 324 nt7.29□□□□□ -1.24
RIM101P33400 YJL086CYJL086C 369 nt7.29□□□□□ -1.24
RIM101P33400 PNP1YLR209C 936 nt7.29□□□□□ -1.24
RIM101P33400 UBC11YOR339C 471 nt7.29□□□□□ -1.24
RIM101P33400 YOR385WYOR385W 873 nt7.29□□□□□ -1.24
RIM101P33400 ATG21YPL100W 1491 nt7.29□□□□□ -1.24
RIM101P33400 AMN1YBR158W 1650 nt7.28□□□□□ -1.24
RIM101P33400 SFB3YHR098C 2790 nt7.28□□□□□ -1.24
RIM101P33400 YIL012WYIL012W 342 nt7.28□□□□□ -1.24
RIM101P33400 RPL40AYIL148W 387 nt7.28□□□□□ -1.24
RIM101P33400 YNL276CYNL276C 396 nt7.28□□□□□ -1.24
RIM101P33400 YJL016WYJL016W 1686 nt7.28□□□□□ -1.24
RIM101P33400 IZH3YLR023C 1632 nt7.27□□□□□ -1.25
RIM101P33400 YDR262WYDR262W 819 nt7.27□□□□□ -1.25
RIM101P33400 TMA22YJR014W 597 nt7.27□□□□□ -1.25
RIM101P33400 COF1YLL050C 432 nt7.27□□□□□ -1.25
RIM101P33400 PIN3YPR154W 648 nt7.27□□□□□ -1.25
RIM101P33400 THI73YLR004C 1572 nt7.27□□□□□ -1.25
RIM101P33400 MCD1YDL003W 1701 nt7.27□□□□□ -1.25
RIM101P33400 CEM1YER061C 1329 nt7.27□□□□□ -1.25
RIM101P33400 HRK1YOR267C 2280 nt7.26□□□□□ -1.25
RIM101P33400 PHO84YML123C 1764 nt7.26□□□□□ -1.25
RIM101P33400 DED81YHR019C 1665 nt7.26□□□□□ -1.25
RIM101P33400 YFL064CYFL064C 525 nt7.26□□□□□ -1.25
RIM101P33400 RPL30YGL030W 318 nt7.26□□□□□ -1.25
RIM101P33400 YPS5YGL259W 498 nt7.26□□□□□ -1.25
RIM101P33400 TRX2YGR209C 315 nt7.26□□□□□ -1.25
RIM101P33400 COX17YLL009C 210 nt7.26□□□□□ -1.25
RIM101P33400 YBL083CYBL083C 426 nt7.26□□□□□ -1.25
RIM101P33400 DPB3YBR278W 606 nt7.26□□□□□ -1.25
RIM101P33400 RPP1AYDL081C 321 nt7.25□□□□□ -1.25
RIM101P33400 HMF1YER057C 390 nt7.25□□□□□ -1.25
RIM101P33400 YLR358CYLR358C 564 nt7.25□□□□□ -1.25
RIM101P33400 RPR1RPR1 369 nt7.25□□□□□ -1.25
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