Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG3P32926 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG3P32926 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG3P32926 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG3P32926 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG3P32926 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG3P32926 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG3P32926 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG3P32926 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG3P32926 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG3P32926 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG3P32926 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG3P32926 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG3P32926 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG3P32926 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG3P32926 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG3P32926 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG3P32926 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG3P32926 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG3P32926 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG3P32926 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG3P32926 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG3P32926 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG3P32926 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG3P32926 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG3P32926 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG3P32926 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG3P32926 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG3P32926 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG3P32926 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG3P32926 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG3P32926 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG3P32926 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG3P32926 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG3P32926 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG3P32926 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG3P32926 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG3P32926 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG3P32926 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG3P32926 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG3P32926 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG3P32926 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG3P32926 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG3P32926 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG3P32926 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG3P32926 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG3P32926 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG3P32926 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG3P32926 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG3P32926 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG3P32926 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG3P32926 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG3P32926 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG3P32926 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG3P32926 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG3P32926 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG3P32926 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG3P32926 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG3P32926 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG3P32926 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG3P32926 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG3P32926 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG3P32926 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG3P32926 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG3P32926 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG3P32926 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG3P32926 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG3P32926 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG3P32926 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DSG3P32926 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DSG3P32926 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DSG3P32926 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DSG3P32926 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DSG3P32926 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG3P32926 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG3P32926 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG3P32926 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG3P32926 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG3P32926 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG3P32926 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG3P32926 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG3P32926 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG3P32926 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG3P32926 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG3P32926 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG3P32926 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG3P32926 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG3P32926 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG3P32926 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG3P32926 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSG3P32926 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSG3P32926 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSG3P32926 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSG3P32926 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DSG3P32926 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DSG3P32926 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSG3P32926 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSG3P32926 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DSG3P32926 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSG3P32926 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms