Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	ARF2	YDL137W	546 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	snR84	snR84	550 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	GDH2	YDL215C	3279 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	JAC1	YGL018C	555 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	NUP159	YIL115C	4383 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	FUN12	YAL035W	3009 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	SWH1	YAR042W	3567 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	OCA2	YNL056W	594 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	YNL235C	YNL235C	432 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	SUI1	YNL244C	327 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	YNL296W	YNL296W	315 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	MCA1	YOR197W	1299 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	FEX1	YOR390W	1128 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	FEX2	YPL279C	1128 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	SYT1	YPR095C	3681 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	IMH1	YLR309C	2736 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	PBP4	YDL053C	558 nt		3.56	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	YDR320W-B	YDR320W-B	138 nt		3.56	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	tX(XXX)D	tX(XXX)D	100 nt		3.56	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	YIR014W	YIR014W	729 nt		3.56	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	CPR7	YJR032W	1182 nt		3.56	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	SIW14	YNL032W	846 nt		3.56	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	YNL109W	YNL109W	546 nt		3.56	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	YNR042W	YNR042W	429 nt		3.56	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	CSM4	YPL200W	471 nt		3.56	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	YGL140C	YGL140C	3660 nt		3.56	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	NRP1	YDL167C	2160 nt		3.56	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	AVT7	YIL088C	1473 nt		3.55	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	GEP4	YHR100C	558 nt		3.55	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	POG1	YIL122W	1056 nt		3.55	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	SYS1	YJL004C	612 nt		3.55	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	YKL202W	YKL202W	582 nt		3.55	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	NNT1	YLR285W	786 nt		3.55	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	YMR254C	YMR254C	309 nt		3.55	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	SUS1	YBR111W-A	291 nt		3.55	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	APD1	YBR151W	951 nt		3.55	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	IMD4	YML056C	1575 nt		3.55	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	DUN1	YDL101C	1542 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	XRS2	YDR369C	2565 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	HMRA1	YCR097W	381 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	snR9	snR9	187 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	DAD1	YDR016C	285 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	YDR018C	YDR018C	1191 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	YDR526C	YDR526C	471 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	PDX1	YGR193C	1233 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	tR(ACG)J	tR(ACG)J	73 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	YAP5	YIR018W	738 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	SOP4	YJL192C	705 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	YJR111C	YJR111C	852 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	PIR1	YKL164C	1026 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	YBL028C	YBL028C	321 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	YMR010W	YMR010W	1218 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	TSR4	YOL022C	1227 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	FUS2	YMR232W	2034 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	PIN4	YBL051C	2007 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	PRM1	YNL279W	1986 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	CHK1	YBR274W	1584 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	JJJ1	YNL227C	1773 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	YKL075C	YKL075C	1353 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	NOP12	YOL041C	1380 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	VHR1	YIL056W	1923 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	snR5	snR5	204 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	TAM41	YGR046W	1158 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	RPL14A	YKL006W	417 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	ERG2	YMR202W	669 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	CIN5	YOR028C	888 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	YBR016W	YBR016W	387 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	DSS4	YPR017C	432 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	GDT1	YBR187W	843 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	TPO5	YKL174C	1857 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	ASI1	YMR119W	1875 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	LAS1	YKR063C	1509 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	MIP6	YHR015W	1980 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	PEX6	YNL329C	3093 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	SPT6	YGR116W	4356 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	YCR001W	YCR001W	315 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	SPT3	YDR392W	1014 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	YEL053W-A	YEL053W-A	348 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	YGL082W	YGL082W	1146 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	THG1	YGR024C	714 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	YGR290W	YGR290W	444 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	YIL165C	YIL165C	360 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	YIL171W	YIL171W	330 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	YKL069W	YKL069W	543 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	YKL070W	YKL070W	510 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	SRP21	YKL122C	504 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	DPB3	YBR278W	606 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	ANR2	YKL047W	1551 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	SWI1	YPL016W	3945 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	OAF3	YKR064W	2592 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	snR68	snR68	136 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	HLR1	YDR528W	1272 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	CGR1	YGL029W	363 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	RPL6B	YLR448W	531 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	INN1	YNL152W	1230 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	MSN1	YOL116W	1149 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	SRL1	YOR247W	633 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	CUR1	YPR158W	759 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	CMD1	YBR109C	444 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SIP1	P32578	YNL284C-A	YNL284C-A	1323 nt		3.5	□□□□□ -1.85

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.5 ms