Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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