Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
EPHB2P29323 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB2P29323 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms