Protein–RNA interactions for Protein: P28356

HOXD9, Homeobox protein Hox-D9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9P28356 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXD9P28356 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD9P28356 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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