Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2AP24928 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms