Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRPH2P23942 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPH2P23942 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms