Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
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