Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPAP23025 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPAP23025 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPAP23025 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.32■■□□□ 1
XPAP23025 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
XPAP23025 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XPAP23025 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XPAP23025 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XPAP23025 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XPAP23025 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XPAP23025 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XPAP23025 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.31■■□□□ 1
XPAP23025 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.31■■□□□ 1
XPAP23025 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
XPAP23025 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.31■■□□□ 1
XPAP23025 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XPAP23025 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XPAP23025 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XPAP23025 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
XPAP23025 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
XPAP23025 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XPAP23025 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XPAP23025 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XPAP23025 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPAP23025 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
XPAP23025 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPAP23025 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPAP23025 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
XPAP23025 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
XPAP23025 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPAP23025 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
XPAP23025 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPAP23025 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
XPAP23025 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPAP23025 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPAP23025 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
XPAP23025 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPAP23025 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
XPAP23025 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPAP23025 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPAP23025 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPAP23025 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPAP23025 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPAP23025 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPAP23025 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.29■■□□□ 1
XPAP23025 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XPAP23025 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.29■■□□□ 1
XPAP23025 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPAP23025 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPAP23025 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPAP23025 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
XPAP23025 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
XPAP23025 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPAP23025 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.29■■□□□ 1
XPAP23025 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
XPAP23025 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.29■■□□□ 1
XPAP23025 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPAP23025 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPAP23025 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
XPAP23025 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPAP23025 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPAP23025 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPAP23025 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPAP23025 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
XPAP23025 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.28■■□□□ 1
XPAP23025 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPAP23025 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPAP23025 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPAP23025 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPAP23025 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPAP23025 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
XPAP23025 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
XPAP23025 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
XPAP23025 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XPAP23025 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
XPAP23025 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XPAP23025 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XPAP23025 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XPAP23025 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
XPAP23025 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
XPAP23025 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XPAP23025 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
XPAP23025 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
XPAP23025 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
XPAP23025 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
XPAP23025 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
XPAP23025 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
XPAP23025 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
XPAP23025 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XPAP23025 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
XPAP23025 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
XPAP23025 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
XPAP23025 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
XPAP23025 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
XPAP23025 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
XPAP23025 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPAP23025 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPAP23025 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPAP23025 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XPAP23025 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms