Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX1P22670 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFX1P22670 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFX1P22670 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFX1P22670 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFX1P22670 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFX1P22670 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFX1P22670 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFX1P22670 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFX1P22670 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFX1P22670 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX1P22670 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX1P22670 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX1P22670 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX1P22670 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX1P22670 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX1P22670 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX1P22670 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX1P22670 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX1P22670 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX1P22670 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX1P22670 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX1P22670 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFX1P22670 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFX1P22670 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RFX1P22670 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFX1P22670 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RFX1P22670 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RFX1P22670 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RFX1P22670 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFX1P22670 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFX1P22670 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RFX1P22670 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFX1P22670 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFX1P22670 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RFX1P22670 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFX1P22670 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX1P22670 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX1P22670 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX1P22670 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX1P22670 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX1P22670 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX1P22670 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX1P22670 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX1P22670 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX1P22670 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX1P22670 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX1P22670 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX1P22670 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX1P22670 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX1P22670 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX1P22670 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX1P22670 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX1P22670 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX1P22670 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX1P22670 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX1P22670 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX1P22670 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX1P22670 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX1P22670 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX1P22670 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX1P22670 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX1P22670 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX1P22670 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX1P22670 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX1P22670 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX1P22670 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX1P22670 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX1P22670 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX1P22670 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX1P22670 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX1P22670 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX1P22670 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX1P22670 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX1P22670 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX1P22670 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX1P22670 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX1P22670 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX1P22670 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX1P22670 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX1P22670 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX1P22670 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX1P22670 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX1P22670 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX1P22670 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX1P22670 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX1P22670 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX1P22670 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RFX1P22670 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RFX1P22670 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX1P22670 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX1P22670 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX1P22670 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX1P22670 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX1P22670 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX1P22670 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX1P22670 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX1P22670 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX1P22670 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX1P22670 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms