Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCP2P22307 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCP2P22307 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCP2P22307 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCP2P22307 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCP2P22307 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCP2P22307 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCP2P22307 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCP2P22307 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCP2P22307 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCP2P22307 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCP2P22307 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCP2P22307 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCP2P22307 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCP2P22307 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCP2P22307 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCP2P22307 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCP2P22307 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCP2P22307 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCP2P22307 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCP2P22307 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCP2P22307 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCP2P22307 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCP2P22307 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCP2P22307 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCP2P22307 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCP2P22307 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCP2P22307 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCP2P22307 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCP2P22307 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCP2P22307 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCP2P22307 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCP2P22307 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCP2P22307 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCP2P22307 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCP2P22307 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCP2P22307 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCP2P22307 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCP2P22307 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCP2P22307 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCP2P22307 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCP2P22307 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCP2P22307 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCP2P22307 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCP2P22307 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCP2P22307 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCP2P22307 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCP2P22307 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCP2P22307 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCP2P22307 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCP2P22307 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCP2P22307 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCP2P22307 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCP2P22307 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCP2P22307 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCP2P22307 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCP2P22307 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCP2P22307 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCP2P22307 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCP2P22307 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SCP2P22307 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCP2P22307 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCP2P22307 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCP2P22307 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCP2P22307 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCP2P22307 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCP2P22307 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCP2P22307 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCP2P22307 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCP2P22307 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCP2P22307 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCP2P22307 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCP2P22307 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCP2P22307 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCP2P22307 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCP2P22307 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCP2P22307 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCP2P22307 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCP2P22307 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCP2P22307 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCP2P22307 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCP2P22307 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCP2P22307 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCP2P22307 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCP2P22307 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCP2P22307 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCP2P22307 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCP2P22307 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCP2P22307 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCP2P22307 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCP2P22307 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCP2P22307 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCP2P22307 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCP2P22307 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCP2P22307 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCP2P22307 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCP2P22307 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCP2P22307 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCP2P22307 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCP2P22307 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms