Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASTP20810 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASTP20810 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASTP20810 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASTP20810 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASTP20810 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASTP20810 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASTP20810 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASTP20810 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASTP20810 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASTP20810 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CASTP20810 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASTP20810 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASTP20810 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASTP20810 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASTP20810 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASTP20810 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASTP20810 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASTP20810 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASTP20810 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASTP20810 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CASTP20810 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASTP20810 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASTP20810 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASTP20810 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASTP20810 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASTP20810 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASTP20810 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASTP20810 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASTP20810 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASTP20810 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASTP20810 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASTP20810 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASTP20810 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASTP20810 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASTP20810 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASTP20810 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASTP20810 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASTP20810 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASTP20810 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASTP20810 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASTP20810 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASTP20810 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASTP20810 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASTP20810 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASTP20810 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASTP20810 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CASTP20810 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CASTP20810 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASTP20810 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASTP20810 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASTP20810 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASTP20810 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASTP20810 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASTP20810 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASTP20810 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASTP20810 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CASTP20810 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASTP20810 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASTP20810 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASTP20810 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASTP20810 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASTP20810 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASTP20810 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASTP20810 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASTP20810 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASTP20810 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASTP20810 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASTP20810 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CASTP20810 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASTP20810 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASTP20810 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASTP20810 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASTP20810 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASTP20810 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASTP20810 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CASTP20810 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASTP20810 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASTP20810 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASTP20810 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASTP20810 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASTP20810 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASTP20810 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASTP20810 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASTP20810 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASTP20810 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASTP20810 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASTP20810 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASTP20810 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASTP20810 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASTP20810 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASTP20810 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASTP20810 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASTP20810 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASTP20810 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASTP20810 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASTP20810 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASTP20810 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASTP20810 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASTP20810 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms