Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKB1P19838 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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NFKB1P19838 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB1P19838 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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