Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCLP19338 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCLP19338 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCLP19338 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCLP19338 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCLP19338 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCLP19338 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCLP19338 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCLP19338 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCLP19338 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCLP19338 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCLP19338 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCLP19338 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCLP19338 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCLP19338 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCLP19338 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCLP19338 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCLP19338 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCLP19338 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCLP19338 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCLP19338 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCLP19338 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCLP19338 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCLP19338 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NCLP19338 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCLP19338 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCLP19338 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCLP19338 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NCLP19338 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCLP19338 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCLP19338 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCLP19338 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCLP19338 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCLP19338 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCLP19338 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCLP19338 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCLP19338 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCLP19338 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCLP19338 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCLP19338 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCLP19338 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCLP19338 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCLP19338 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCLP19338 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCLP19338 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCLP19338 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCLP19338 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCLP19338 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCLP19338 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCLP19338 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCLP19338 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCLP19338 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCLP19338 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCLP19338 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NCLP19338 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCLP19338 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCLP19338 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCLP19338 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCLP19338 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCLP19338 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCLP19338 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCLP19338 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCLP19338 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCLP19338 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCLP19338 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCLP19338 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCLP19338 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCLP19338 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCLP19338 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCLP19338 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCLP19338 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCLP19338 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCLP19338 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NCLP19338 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCLP19338 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCLP19338 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCLP19338 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCLP19338 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCLP19338 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCLP19338 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCLP19338 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCLP19338 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCLP19338 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCLP19338 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCLP19338 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCLP19338 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCLP19338 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCLP19338 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCLP19338 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCLP19338 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCLP19338 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCLP19338 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCLP19338 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCLP19338 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCLP19338 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCLP19338 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCLP19338 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCLP19338 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCLP19338 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCLP19338 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms