Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMPD1P17405 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMPD1P17405 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms