Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms