Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD44P16070 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD44P16070 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD44P16070 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD44P16070 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD44P16070 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD44P16070 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD44P16070 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD44P16070 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD44P16070 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD44P16070 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD44P16070 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD44P16070 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD44P16070 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD44P16070 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CD44P16070 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD44P16070 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD44P16070 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD44P16070 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD44P16070 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD44P16070 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CD44P16070 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CD44P16070 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD44P16070 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD44P16070 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD44P16070 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD44P16070 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD44P16070 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD44P16070 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD44P16070 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD44P16070 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD44P16070 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD44P16070 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD44P16070 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD44P16070 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CD44P16070 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD44P16070 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD44P16070 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD44P16070 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD44P16070 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD44P16070 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD44P16070 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CD44P16070 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD44P16070 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CD44P16070 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD44P16070 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD44P16070 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CD44P16070 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CD44P16070 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD44P16070 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CD44P16070 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD44P16070 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD44P16070 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD44P16070 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD44P16070 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD44P16070 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD44P16070 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD44P16070 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD44P16070 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD44P16070 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD44P16070 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD44P16070 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD44P16070 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD44P16070 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD44P16070 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD44P16070 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD44P16070 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD44P16070 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD44P16070 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD44P16070 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD44P16070 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD44P16070 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD44P16070 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD44P16070 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD44P16070 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD44P16070 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD44P16070 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD44P16070 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD44P16070 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD44P16070 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD44P16070 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD44P16070 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD44P16070 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD44P16070 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD44P16070 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD44P16070 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD44P16070 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CD44P16070 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CD44P16070 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD44P16070 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD44P16070 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD44P16070 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD44P16070 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD44P16070 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD44P16070 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD44P16070 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD44P16070 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD44P16070 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CD44P16070 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD44P16070 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms