Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM27P14373 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms