Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKCSHP14314 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms