Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HLA-DOBP13765 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms